Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTPAP49638 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTPAP49638 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTPAP49638 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTPAP49638 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTPAP49638 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTPAP49638 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TTPAP49638 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTPAP49638 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTPAP49638 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTPAP49638 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTPAP49638 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTPAP49638 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTPAP49638 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTPAP49638 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TTPAP49638 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTPAP49638 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TTPAP49638 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTPAP49638 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTPAP49638 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTPAP49638 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTPAP49638 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTPAP49638 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTPAP49638 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTPAP49638 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTPAP49638 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTPAP49638 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTPAP49638 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTPAP49638 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTPAP49638 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTPAP49638 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTPAP49638 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTPAP49638 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTPAP49638 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTPAP49638 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTPAP49638 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTPAP49638 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTPAP49638 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTPAP49638 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTPAP49638 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTPAP49638 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTPAP49638 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTPAP49638 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTPAP49638 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTPAP49638 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTPAP49638 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTPAP49638 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTPAP49638 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTPAP49638 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTPAP49638 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTPAP49638 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTPAP49638 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTPAP49638 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTPAP49638 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTPAP49638 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTPAP49638 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTPAP49638 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTPAP49638 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTPAP49638 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TTPAP49638 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTPAP49638 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTPAP49638 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTPAP49638 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTPAP49638 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTPAP49638 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTPAP49638 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTPAP49638 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTPAP49638 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTPAP49638 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTPAP49638 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTPAP49638 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTPAP49638 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTPAP49638 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTPAP49638 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTPAP49638 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTPAP49638 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTPAP49638 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TTPAP49638 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTPAP49638 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTPAP49638 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTPAP49638 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTPAP49638 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTPAP49638 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTPAP49638 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTPAP49638 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTPAP49638 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTPAP49638 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TTPAP49638 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTPAP49638 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTPAP49638 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTPAP49638 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTPAP49638 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTPAP49638 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTPAP49638 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTPAP49638 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTPAP49638 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTPAP49638 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTPAP49638 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTPAP49638 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTPAP49638 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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