Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPAP49450 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPAP49450 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPAP49450 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPAP49450 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPAP49450 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPAP49450 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPAP49450 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPAP49450 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPAP49450 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPAP49450 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPAP49450 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPAP49450 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPAP49450 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPAP49450 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPAP49450 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPAP49450 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPAP49450 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPAP49450 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPAP49450 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPAP49450 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPAP49450 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPAP49450 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPAP49450 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPAP49450 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPAP49450 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPAP49450 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPAP49450 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPAP49450 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPAP49450 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPAP49450 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPAP49450 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPAP49450 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPAP49450 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPAP49450 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPAP49450 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPAP49450 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPAP49450 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPAP49450 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPAP49450 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPAP49450 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPAP49450 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPAP49450 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPAP49450 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPAP49450 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPAP49450 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPAP49450 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPAP49450 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPAP49450 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPAP49450 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPAP49450 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CENPAP49450 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CENPAP49450 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPAP49450 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPAP49450 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPAP49450 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPAP49450 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPAP49450 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPAP49450 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPAP49450 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPAP49450 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPAP49450 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPAP49450 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPAP49450 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPAP49450 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPAP49450 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPAP49450 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPAP49450 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPAP49450 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPAP49450 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPAP49450 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPAP49450 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPAP49450 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPAP49450 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPAP49450 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPAP49450 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPAP49450 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPAP49450 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPAP49450 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPAP49450 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPAP49450 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPAP49450 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPAP49450 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPAP49450 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPAP49450 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPAP49450 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPAP49450 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPAP49450 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPAP49450 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPAP49450 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPAP49450 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPAP49450 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPAP49450 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPAP49450 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPAP49450 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPAP49450 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPAP49450 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPAP49450 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPAP49450 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPAP49450 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms