Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUFMP49411 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUFMP49411 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUFMP49411 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUFMP49411 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUFMP49411 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUFMP49411 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUFMP49411 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUFMP49411 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUFMP49411 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TUFMP49411 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUFMP49411 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUFMP49411 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUFMP49411 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUFMP49411 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUFMP49411 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUFMP49411 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUFMP49411 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUFMP49411 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUFMP49411 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUFMP49411 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TUFMP49411 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUFMP49411 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUFMP49411 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUFMP49411 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUFMP49411 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUFMP49411 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUFMP49411 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUFMP49411 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUFMP49411 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUFMP49411 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUFMP49411 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUFMP49411 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUFMP49411 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUFMP49411 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUFMP49411 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUFMP49411 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUFMP49411 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUFMP49411 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUFMP49411 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUFMP49411 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUFMP49411 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUFMP49411 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUFMP49411 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TUFMP49411 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUFMP49411 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUFMP49411 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUFMP49411 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TUFMP49411 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUFMP49411 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUFMP49411 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUFMP49411 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUFMP49411 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUFMP49411 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUFMP49411 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUFMP49411 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUFMP49411 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUFMP49411 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUFMP49411 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUFMP49411 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUFMP49411 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TUFMP49411 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUFMP49411 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUFMP49411 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUFMP49411 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TUFMP49411 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUFMP49411 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUFMP49411 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUFMP49411 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUFMP49411 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUFMP49411 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUFMP49411 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUFMP49411 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUFMP49411 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUFMP49411 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUFMP49411 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUFMP49411 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUFMP49411 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUFMP49411 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUFMP49411 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUFMP49411 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUFMP49411 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUFMP49411 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUFMP49411 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUFMP49411 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUFMP49411 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUFMP49411 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUFMP49411 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUFMP49411 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUFMP49411 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUFMP49411 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TUFMP49411 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUFMP49411 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUFMP49411 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUFMP49411 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TUFMP49411 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUFMP49411 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUFMP49411 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUFMP49411 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUFMP49411 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms