Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCLCP48506 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCLCP48506 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCLCP48506 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCLCP48506 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCLCP48506 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCLCP48506 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCLCP48506 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCLCP48506 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCLCP48506 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCLCP48506 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCLCP48506 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCLCP48506 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCLCP48506 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCLCP48506 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCLCP48506 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCLCP48506 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCLCP48506 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCLCP48506 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCLCP48506 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCLCP48506 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCLCP48506 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCLCP48506 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCLCP48506 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCLCP48506 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCLCP48506 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCLCP48506 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCLCP48506 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCLCP48506 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GCLCP48506 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCLCP48506 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCLCP48506 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GCLCP48506 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GCLCP48506 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GCLCP48506 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GCLCP48506 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GCLCP48506 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GCLCP48506 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GCLCP48506 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCLCP48506 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GCLCP48506 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCLCP48506 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GCLCP48506 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCLCP48506 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCLCP48506 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCLCP48506 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCLCP48506 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCLCP48506 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCLCP48506 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCLCP48506 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCLCP48506 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCLCP48506 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCLCP48506 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCLCP48506 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCLCP48506 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCLCP48506 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCLCP48506 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCLCP48506 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCLCP48506 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCLCP48506 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCLCP48506 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCLCP48506 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCLCP48506 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCLCP48506 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCLCP48506 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCLCP48506 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GCLCP48506 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCLCP48506 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCLCP48506 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCLCP48506 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GCLCP48506 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GCLCP48506 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCLCP48506 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCLCP48506 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GCLCP48506 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GCLCP48506 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GCLCP48506 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GCLCP48506 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCLCP48506 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCLCP48506 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCLCP48506 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GCLCP48506 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCLCP48506 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCLCP48506 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCLCP48506 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCLCP48506 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCLCP48506 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCLCP48506 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCLCP48506 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCLCP48506 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCLCP48506 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCLCP48506 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCLCP48506 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCLCP48506 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCLCP48506 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCLCP48506 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCLCP48506 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCLCP48506 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GCLCP48506 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GCLCP48506 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms