Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARCN1P48444 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms