Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ME1P48163 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ME1P48163 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ME1P48163 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ME1P48163 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ME1P48163 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ME1P48163 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ME1P48163 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ME1P48163 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ME1P48163 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ME1P48163 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ME1P48163 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ME1P48163 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ME1P48163 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ME1P48163 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ME1P48163 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ME1P48163 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ME1P48163 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ME1P48163 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ME1P48163 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ME1P48163 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ME1P48163 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ME1P48163 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ME1P48163 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ME1P48163 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ME1P48163 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ME1P48163 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ME1P48163 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ME1P48163 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ME1P48163 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ME1P48163 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ME1P48163 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ME1P48163 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ME1P48163 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ME1P48163 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ME1P48163 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ME1P48163 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ME1P48163 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ME1P48163 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ME1P48163 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ME1P48163 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ME1P48163 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ME1P48163 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ME1P48163 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ME1P48163 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ME1P48163 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ME1P48163 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ME1P48163 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ME1P48163 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ME1P48163 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ME1P48163 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ME1P48163 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ME1P48163 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ME1P48163 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ME1P48163 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ME1P48163 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ME1P48163 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ME1P48163 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ME1P48163 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ME1P48163 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ME1P48163 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ME1P48163 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ME1P48163 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ME1P48163 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ME1P48163 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ME1P48163 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ME1P48163 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ME1P48163 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ME1P48163 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ME1P48163 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ME1P48163 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ME1P48163 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ME1P48163 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ME1P48163 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ME1P48163 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ME1P48163 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ME1P48163 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ME1P48163 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ME1P48163 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ME1P48163 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ME1P48163 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ME1P48163 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ME1P48163 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ME1P48163 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ME1P48163 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ME1P48163 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ME1P48163 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ME1P48163 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ME1P48163 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ME1P48163 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ME1P48163 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ME1P48163 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ME1P48163 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ME1P48163 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ME1P48163 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ME1P48163 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ME1P48163 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ME1P48163 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ME1P48163 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ME1P48163 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms