Protein–RNA interactions for Protein: P47872

SCTR, Secretin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCTRP47872 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCTRP47872 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCTRP47872 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCTRP47872 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCTRP47872 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCTRP47872 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCTRP47872 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCTRP47872 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCTRP47872 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCTRP47872 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCTRP47872 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCTRP47872 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCTRP47872 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCTRP47872 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCTRP47872 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCTRP47872 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCTRP47872 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCTRP47872 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCTRP47872 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCTRP47872 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCTRP47872 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCTRP47872 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCTRP47872 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCTRP47872 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCTRP47872 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCTRP47872 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCTRP47872 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCTRP47872 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCTRP47872 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCTRP47872 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCTRP47872 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCTRP47872 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCTRP47872 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCTRP47872 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCTRP47872 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCTRP47872 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCTRP47872 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCTRP47872 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCTRP47872 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCTRP47872 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCTRP47872 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCTRP47872 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCTRP47872 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCTRP47872 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCTRP47872 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCTRP47872 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCTRP47872 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCTRP47872 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCTRP47872 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCTRP47872 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCTRP47872 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCTRP47872 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCTRP47872 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCTRP47872 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCTRP47872 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCTRP47872 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCTRP47872 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCTRP47872 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCTRP47872 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCTRP47872 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCTRP47872 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCTRP47872 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCTRP47872 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCTRP47872 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCTRP47872 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCTRP47872 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCTRP47872 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCTRP47872 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCTRP47872 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCTRP47872 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCTRP47872 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCTRP47872 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCTRP47872 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCTRP47872 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCTRP47872 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCTRP47872 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCTRP47872 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCTRP47872 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCTRP47872 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCTRP47872 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCTRP47872 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCTRP47872 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCTRP47872 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCTRP47872 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCTRP47872 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCTRP47872 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCTRP47872 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCTRP47872 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCTRP47872 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCTRP47872 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCTRP47872 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCTRP47872 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCTRP47872 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCTRP47872 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCTRP47872 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCTRP47872 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCTRP47872 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCTRP47872 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCTRP47872 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCTRP47872 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms