Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSN1S1P47710 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSN1S1P47710 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSN1S1P47710 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSN1S1P47710 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSN1S1P47710 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSN1S1P47710 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSN1S1P47710 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSN1S1P47710 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSN1S1P47710 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSN1S1P47710 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSN1S1P47710 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSN1S1P47710 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSN1S1P47710 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSN1S1P47710 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSN1S1P47710 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSN1S1P47710 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSN1S1P47710 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSN1S1P47710 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSN1S1P47710 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSN1S1P47710 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSN1S1P47710 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSN1S1P47710 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSN1S1P47710 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSN1S1P47710 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSN1S1P47710 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSN1S1P47710 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSN1S1P47710 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSN1S1P47710 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSN1S1P47710 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSN1S1P47710 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CSN1S1P47710 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSN1S1P47710 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSN1S1P47710 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms