Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACADSBP45954 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms