Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD52P43351 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD52P43351 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD52P43351 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD52P43351 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD52P43351 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD52P43351 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD52P43351 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD52P43351 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD52P43351 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD52P43351 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD52P43351 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD52P43351 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD52P43351 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD52P43351 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD52P43351 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD52P43351 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD52P43351 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD52P43351 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD52P43351 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD52P43351 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD52P43351 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD52P43351 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD52P43351 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD52P43351 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD52P43351 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD52P43351 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD52P43351 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD52P43351 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD52P43351 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD52P43351 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD52P43351 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD52P43351 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD52P43351 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD52P43351 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD52P43351 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD52P43351 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD52P43351 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD52P43351 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD52P43351 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD52P43351 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD52P43351 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD52P43351 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD52P43351 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD52P43351 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD52P43351 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD52P43351 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD52P43351 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD52P43351 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD52P43351 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD52P43351 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD52P43351 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD52P43351 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD52P43351 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD52P43351 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD52P43351 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD52P43351 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD52P43351 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD52P43351 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD52P43351 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD52P43351 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAD52P43351 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD52P43351 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD52P43351 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD52P43351 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD52P43351 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD52P43351 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD52P43351 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD52P43351 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD52P43351 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD52P43351 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD52P43351 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD52P43351 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD52P43351 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD52P43351 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD52P43351 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD52P43351 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD52P43351 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD52P43351 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD52P43351 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD52P43351 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD52P43351 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD52P43351 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD52P43351 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD52P43351 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD52P43351 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD52P43351 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD52P43351 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD52P43351 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD52P43351 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD52P43351 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD52P43351 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD52P43351 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD52P43351 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD52P43351 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD52P43351 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD52P43351 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD52P43351 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD52P43351 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD52P43351 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms