Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCAMP43121 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MCAMP43121 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCAMP43121 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCAMP43121 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCAMP43121 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCAMP43121 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCAMP43121 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCAMP43121 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCAMP43121 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCAMP43121 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCAMP43121 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCAMP43121 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCAMP43121 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCAMP43121 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MCAMP43121 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCAMP43121 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCAMP43121 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCAMP43121 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCAMP43121 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCAMP43121 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCAMP43121 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCAMP43121 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCAMP43121 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCAMP43121 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCAMP43121 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCAMP43121 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCAMP43121 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCAMP43121 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCAMP43121 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCAMP43121 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCAMP43121 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCAMP43121 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
MCAMP43121 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
MCAMP43121 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
MCAMP43121 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCAMP43121 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCAMP43121 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCAMP43121 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCAMP43121 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCAMP43121 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCAMP43121 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCAMP43121 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCAMP43121 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCAMP43121 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCAMP43121 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCAMP43121 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCAMP43121 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCAMP43121 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCAMP43121 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCAMP43121 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCAMP43121 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCAMP43121 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCAMP43121 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCAMP43121 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCAMP43121 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCAMP43121 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCAMP43121 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCAMP43121 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCAMP43121 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCAMP43121 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCAMP43121 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MCAMP43121 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCAMP43121 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCAMP43121 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCAMP43121 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCAMP43121 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCAMP43121 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCAMP43121 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCAMP43121 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCAMP43121 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCAMP43121 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCAMP43121 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCAMP43121 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCAMP43121 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCAMP43121 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCAMP43121 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCAMP43121 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCAMP43121 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCAMP43121 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCAMP43121 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCAMP43121 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MCAMP43121 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCAMP43121 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCAMP43121 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCAMP43121 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCAMP43121 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCAMP43121 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCAMP43121 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCAMP43121 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCAMP43121 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCAMP43121 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCAMP43121 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCAMP43121 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MCAMP43121 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCAMP43121 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCAMP43121 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCAMP43121 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCAMP43121 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCAMP43121 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms