Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP3P42574 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CASP3P42574 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP3P42574 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP3P42574 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP3P42574 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP3P42574 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP3P42574 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP3P42574 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CASP3P42574 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP3P42574 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP3P42574 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP3P42574 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP3P42574 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP3P42574 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP3P42574 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP3P42574 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP3P42574 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP3P42574 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP3P42574 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP3P42574 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP3P42574 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP3P42574 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP3P42574 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP3P42574 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP3P42574 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP3P42574 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP3P42574 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP3P42574 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP3P42574 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP3P42574 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP3P42574 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP3P42574 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP3P42574 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP3P42574 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP3P42574 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASP3P42574 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASP3P42574 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP3P42574 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP3P42574 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP3P42574 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP3P42574 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP3P42574 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP3P42574 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP3P42574 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP3P42574 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP3P42574 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP3P42574 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP3P42574 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP3P42574 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP3P42574 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP3P42574 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP3P42574 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP3P42574 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP3P42574 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP3P42574 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP3P42574 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP3P42574 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP3P42574 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP3P42574 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP3P42574 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP3P42574 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP3P42574 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP3P42574 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP3P42574 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP3P42574 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP3P42574 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP3P42574 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP3P42574 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP3P42574 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP3P42574 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP3P42574 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP3P42574 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP3P42574 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP3P42574 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP3P42574 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP3P42574 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP3P42574 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP3P42574 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP3P42574 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP3P42574 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP3P42574 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP3P42574 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP3P42574 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP3P42574 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP3P42574 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP3P42574 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP3P42574 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP3P42574 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP3P42574 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP3P42574 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP3P42574 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP3P42574 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP3P42574 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP3P42574 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP3P42574 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP3P42574 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP3P42574 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP3P42574 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP3P42574 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms