Protein–RNA interactions for Protein: P41247

PNPLA4, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA4P41247 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNPLA4P41247 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNPLA4P41247 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNPLA4P41247 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNPLA4P41247 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PNPLA4P41247 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNPLA4P41247 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNPLA4P41247 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNPLA4P41247 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNPLA4P41247 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNPLA4P41247 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNPLA4P41247 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNPLA4P41247 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PNPLA4P41247 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNPLA4P41247 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNPLA4P41247 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNPLA4P41247 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNPLA4P41247 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNPLA4P41247 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNPLA4P41247 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNPLA4P41247 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNPLA4P41247 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNPLA4P41247 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNPLA4P41247 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNPLA4P41247 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNPLA4P41247 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNPLA4P41247 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PNPLA4P41247 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNPLA4P41247 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PNPLA4P41247 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNPLA4P41247 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms