Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGCXP38435 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGCXP38435 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGCXP38435 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGCXP38435 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGCXP38435 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGCXP38435 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGCXP38435 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGCXP38435 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGCXP38435 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGCXP38435 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GGCXP38435 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGCXP38435 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGCXP38435 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGCXP38435 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGCXP38435 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGCXP38435 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGCXP38435 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGCXP38435 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGCXP38435 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGCXP38435 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGCXP38435 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGCXP38435 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGCXP38435 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGCXP38435 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGCXP38435 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGCXP38435 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGCXP38435 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGCXP38435 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGCXP38435 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGCXP38435 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGCXP38435 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGCXP38435 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGCXP38435 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGCXP38435 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGCXP38435 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGCXP38435 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GGCXP38435 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GGCXP38435 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GGCXP38435 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GGCXP38435 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GGCXP38435 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGCXP38435 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGCXP38435 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGCXP38435 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GGCXP38435 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGCXP38435 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGCXP38435 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GGCXP38435 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGCXP38435 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGCXP38435 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGCXP38435 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGCXP38435 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGCXP38435 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGCXP38435 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGCXP38435 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGCXP38435 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGCXP38435 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGCXP38435 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGCXP38435 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGCXP38435 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGCXP38435 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGCXP38435 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGCXP38435 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGCXP38435 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGCXP38435 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGCXP38435 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGCXP38435 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GGCXP38435 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGCXP38435 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGCXP38435 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGCXP38435 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGCXP38435 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGCXP38435 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGCXP38435 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGCXP38435 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGCXP38435 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGCXP38435 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGCXP38435 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GGCXP38435 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGCXP38435 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGCXP38435 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGCXP38435 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGCXP38435 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGCXP38435 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GGCXP38435 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGCXP38435 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGCXP38435 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGCXP38435 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGCXP38435 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGCXP38435 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGCXP38435 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGCXP38435 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GGCXP38435 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGCXP38435 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGCXP38435 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGCXP38435 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GGCXP38435 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGCXP38435 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGCXP38435 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms