Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHKAP35790 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHKAP35790 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHKAP35790 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHKAP35790 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHKAP35790 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHKAP35790 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHKAP35790 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHKAP35790 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHKAP35790 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHKAP35790 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHKAP35790 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHKAP35790 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHKAP35790 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHKAP35790 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHKAP35790 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHKAP35790 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHKAP35790 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHKAP35790 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHKAP35790 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHKAP35790 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHKAP35790 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHKAP35790 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHKAP35790 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHKAP35790 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHKAP35790 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHKAP35790 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHKAP35790 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHKAP35790 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHKAP35790 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHKAP35790 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHKAP35790 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHKAP35790 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHKAP35790 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHKAP35790 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHKAP35790 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHKAP35790 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHKAP35790 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHKAP35790 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHKAP35790 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHKAP35790 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHKAP35790 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHKAP35790 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHKAP35790 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHKAP35790 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHKAP35790 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHKAP35790 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHKAP35790 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHKAP35790 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHKAP35790 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHKAP35790 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHKAP35790 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHKAP35790 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHKAP35790 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHKAP35790 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHKAP35790 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHKAP35790 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHKAP35790 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHKAP35790 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHKAP35790 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHKAP35790 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHKAP35790 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHKAP35790 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHKAP35790 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHKAP35790 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHKAP35790 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHKAP35790 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHKAP35790 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHKAP35790 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHKAP35790 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHKAP35790 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHKAP35790 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHKAP35790 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHKAP35790 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHKAP35790 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHKAP35790 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHKAP35790 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHKAP35790 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHKAP35790 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHKAP35790 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHKAP35790 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHKAP35790 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHKAP35790 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHKAP35790 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHKAP35790 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHKAP35790 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHKAP35790 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHKAP35790 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHKAP35790 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHKAP35790 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CHKAP35790 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHKAP35790 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHKAP35790 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHKAP35790 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHKAP35790 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHKAP35790 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHKAP35790 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHKAP35790 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHKAP35790 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHKAP35790 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms