Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
DDIT3P35638 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DDIT3P35638 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDIT3P35638 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms