Protein–RNA interactions for Protein: P33947

KDELR2, ER lumen protein-retaining receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR2P33947 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KDELR2P33947 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KDELR2P33947 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KDELR2P33947 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KDELR2P33947 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR2P33947 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR2P33947 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR2P33947 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR2P33947 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR2P33947 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KDELR2P33947 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR2P33947 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR2P33947 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR2P33947 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR2P33947 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR2P33947 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR2P33947 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR2P33947 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR2P33947 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR2P33947 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR2P33947 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR2P33947 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR2P33947 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR2P33947 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR2P33947 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR2P33947 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR2P33947 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR2P33947 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR2P33947 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR2P33947 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR2P33947 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KDELR2P33947 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR2P33947 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR2P33947 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR2P33947 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR2P33947 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR2P33947 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR2P33947 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR2P33947 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR2P33947 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR2P33947 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDELR2P33947 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDELR2P33947 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDELR2P33947 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDELR2P33947 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDELR2P33947 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDELR2P33947 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KDELR2P33947 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KDELR2P33947 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDELR2P33947 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDELR2P33947 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KDELR2P33947 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDELR2P33947 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
KDELR2P33947 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
KDELR2P33947 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDELR2P33947 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDELR2P33947 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KDELR2P33947 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDELR2P33947 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms