Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSP1P33241 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSP1P33241 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSP1P33241 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSP1P33241 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSP1P33241 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LSP1P33241 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSP1P33241 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSP1P33241 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSP1P33241 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSP1P33241 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSP1P33241 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSP1P33241 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSP1P33241 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSP1P33241 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSP1P33241 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSP1P33241 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSP1P33241 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSP1P33241 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSP1P33241 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSP1P33241 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSP1P33241 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSP1P33241 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSP1P33241 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSP1P33241 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSP1P33241 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSP1P33241 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LSP1P33241 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSP1P33241 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSP1P33241 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSP1P33241 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSP1P33241 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSP1P33241 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSP1P33241 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSP1P33241 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSP1P33241 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSP1P33241 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSP1P33241 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSP1P33241 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSP1P33241 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSP1P33241 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSP1P33241 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSP1P33241 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSP1P33241 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LSP1P33241 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSP1P33241 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSP1P33241 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LSP1P33241 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSP1P33241 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSP1P33241 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSP1P33241 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSP1P33241 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSP1P33241 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSP1P33241 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSP1P33241 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSP1P33241 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSP1P33241 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSP1P33241 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSP1P33241 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSP1P33241 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSP1P33241 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSP1P33241 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSP1P33241 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSP1P33241 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSP1P33241 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSP1P33241 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSP1P33241 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSP1P33241 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSP1P33241 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSP1P33241 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSP1P33241 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSP1P33241 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSP1P33241 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSP1P33241 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSP1P33241 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSP1P33241 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSP1P33241 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSP1P33241 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSP1P33241 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSP1P33241 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSP1P33241 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSP1P33241 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSP1P33241 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSP1P33241 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSP1P33241 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSP1P33241 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSP1P33241 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSP1P33241 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSP1P33241 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSP1P33241 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSP1P33241 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LSP1P33241 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSP1P33241 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSP1P33241 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LSP1P33241 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSP1P33241 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSP1P33241 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSP1P33241 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSP1P33241 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSP1P33241 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms