Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC13P31276 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC13P31276 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC13P31276 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms