Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TM4SF1P30408 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms