Protein–RNA interactions for Protein: P30307

CDC25C, M-phase inducer phosphatase 3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25CP30307 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDC25CP30307 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDC25CP30307 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC25CP30307 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms