Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMOD1P29536 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMOD1P29536 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms