Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
COL4A5P29400 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
COL4A5P29400 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms