Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
KDM5AP29375 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KDM5AP29375 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM5AP29375 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms