Protein–RNA interactions for Protein: P26998

CRYBB3, Beta-crystallin B3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBB3P26998 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CRYBB3P26998 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRYBB3P26998 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms