Protein–RNA interactions for Protein: P26440

IVD, Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IVDP26440 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IVDP26440 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IVDP26440 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IVDP26440 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IVDP26440 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IVDP26440 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IVDP26440 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IVDP26440 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IVDP26440 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IVDP26440 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IVDP26440 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IVDP26440 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IVDP26440 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IVDP26440 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IVDP26440 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IVDP26440 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IVDP26440 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IVDP26440 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IVDP26440 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IVDP26440 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IVDP26440 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IVDP26440 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IVDP26440 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IVDP26440 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IVDP26440 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IVDP26440 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IVDP26440 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IVDP26440 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IVDP26440 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IVDP26440 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IVDP26440 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IVDP26440 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IVDP26440 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IVDP26440 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IVDP26440 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IVDP26440 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IVDP26440 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IVDP26440 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IVDP26440 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IVDP26440 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IVDP26440 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IVDP26440 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IVDP26440 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IVDP26440 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IVDP26440 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IVDP26440 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IVDP26440 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IVDP26440 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IVDP26440 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IVDP26440 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IVDP26440 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IVDP26440 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IVDP26440 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IVDP26440 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IVDP26440 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IVDP26440 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IVDP26440 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IVDP26440 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IVDP26440 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IVDP26440 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IVDP26440 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IVDP26440 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IVDP26440 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IVDP26440 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IVDP26440 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IVDP26440 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IVDP26440 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IVDP26440 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IVDP26440 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
IVDP26440 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IVDP26440 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IVDP26440 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IVDP26440 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IVDP26440 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IVDP26440 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IVDP26440 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IVDP26440 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IVDP26440 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IVDP26440 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IVDP26440 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IVDP26440 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IVDP26440 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IVDP26440 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IVDP26440 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IVDP26440 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IVDP26440 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IVDP26440 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IVDP26440 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IVDP26440 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IVDP26440 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IVDP26440 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IVDP26440 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IVDP26440 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IVDP26440 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IVDP26440 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IVDP26440 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IVDP26440 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IVDP26440 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IVDP26440 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IVDP26440 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms