Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMA3P25788 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMA3P25788 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms