Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCM3P25205 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCM3P25205 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCM3P25205 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MCM3P25205 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCM3P25205 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCM3P25205 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCM3P25205 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCM3P25205 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
MCM3P25205 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCM3P25205 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM3P25205 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM3P25205 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM3P25205 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM3P25205 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM3P25205 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM3P25205 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM3P25205 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM3P25205 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM3P25205 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM3P25205 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM3P25205 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM3P25205 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM3P25205 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM3P25205 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM3P25205 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM3P25205 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM3P25205 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM3P25205 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM3P25205 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM3P25205 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM3P25205 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM3P25205 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM3P25205 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM3P25205 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM3P25205 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM3P25205 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM3P25205 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM3P25205 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM3P25205 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM3P25205 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM3P25205 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM3P25205 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM3P25205 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM3P25205 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM3P25205 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM3P25205 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM3P25205 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM3P25205 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM3P25205 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM3P25205 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM3P25205 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM3P25205 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM3P25205 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM3P25205 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM3P25205 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM3P25205 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM3P25205 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM3P25205 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM3P25205 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM3P25205 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM3P25205 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM3P25205 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM3P25205 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM3P25205 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM3P25205 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM3P25205 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM3P25205 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM3P25205 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM3P25205 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM3P25205 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM3P25205 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM3P25205 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM3P25205 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM3P25205 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM3P25205 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM3P25205 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM3P25205 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM3P25205 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM3P25205 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM3P25205 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM3P25205 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM3P25205 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM3P25205 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM3P25205 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM3P25205 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM3P25205 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM3P25205 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCM3P25205 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCM3P25205 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCM3P25205 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM3P25205 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM3P25205 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM3P25205 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM3P25205 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM3P25205 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM3P25205 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM3P25205 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM3P25205 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM3P25205 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms