Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKCHP24723 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
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