Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND1P24385 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND1P24385 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND1P24385 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND1P24385 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND1P24385 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND1P24385 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND1P24385 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND1P24385 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCND1P24385 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCND1P24385 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCND1P24385 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCND1P24385 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCND1P24385 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCND1P24385 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCND1P24385 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCND1P24385 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCND1P24385 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCND1P24385 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCND1P24385 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCND1P24385 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCND1P24385 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCND1P24385 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCND1P24385 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCND1P24385 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCND1P24385 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCND1P24385 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCND1P24385 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCND1P24385 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCND1P24385 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCND1P24385 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCND1P24385 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCND1P24385 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCND1P24385 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCND1P24385 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCND1P24385 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCND1P24385 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCND1P24385 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCND1P24385 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCND1P24385 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCND1P24385 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCND1P24385 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCND1P24385 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCND1P24385 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCND1P24385 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCND1P24385 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCND1P24385 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCND1P24385 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCND1P24385 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCND1P24385 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCND1P24385 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCND1P24385 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCND1P24385 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCND1P24385 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCND1P24385 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCND1P24385 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCND1P24385 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCND1P24385 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCND1P24385 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCND1P24385 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCND1P24385 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCND1P24385 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCND1P24385 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCND1P24385 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCND1P24385 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCND1P24385 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCND1P24385 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCND1P24385 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCND1P24385 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCND1P24385 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCND1P24385 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCND1P24385 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCND1P24385 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCND1P24385 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCND1P24385 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCND1P24385 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND1P24385 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND1P24385 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND1P24385 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND1P24385 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND1P24385 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND1P24385 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND1P24385 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND1P24385 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND1P24385 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND1P24385 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND1P24385 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND1P24385 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND1P24385 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND1P24385 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND1P24385 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND1P24385 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND1P24385 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND1P24385 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND1P24385 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND1P24385 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND1P24385 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND1P24385 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND1P24385 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND1P24385 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms