Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms