Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRDP23468 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRDP23468 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
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