Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RPS6KB1P23443 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms