Protein–RNA interactions for Protein: P23083

IGHV1-2, Immunoglobulin heavy variable 1-2, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-2P23083 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHV1-2P23083 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHV1-2P23083 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHV1-2P23083 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHV1-2P23083 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHV1-2P23083 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHV1-2P23083 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHV1-2P23083 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHV1-2P23083 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHV1-2P23083 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHV1-2P23083 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHV1-2P23083 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHV1-2P23083 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHV1-2P23083 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHV1-2P23083 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHV1-2P23083 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHV1-2P23083 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHV1-2P23083 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHV1-2P23083 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHV1-2P23083 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHV1-2P23083 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHV1-2P23083 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHV1-2P23083 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHV1-2P23083 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHV1-2P23083 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHV1-2P23083 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHV1-2P23083 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHV1-2P23083 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGHV1-2P23083 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IGHV1-2P23083 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IGHV1-2P23083 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
IGHV1-2P23083 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGHV1-2P23083 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGHV1-2P23083 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGHV1-2P23083 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGHV1-2P23083 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IGHV1-2P23083 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IGHV1-2P23083 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms