Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACO1P21399 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACO1P21399 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACO1P21399 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACO1P21399 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACO1P21399 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACO1P21399 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACO1P21399 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACO1P21399 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACO1P21399 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACO1P21399 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACO1P21399 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACO1P21399 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACO1P21399 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACO1P21399 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACO1P21399 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACO1P21399 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACO1P21399 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACO1P21399 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACO1P21399 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACO1P21399 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACO1P21399 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACO1P21399 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACO1P21399 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACO1P21399 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACO1P21399 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACO1P21399 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACO1P21399 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACO1P21399 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ACO1P21399 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACO1P21399 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACO1P21399 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACO1P21399 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACO1P21399 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACO1P21399 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACO1P21399 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACO1P21399 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACO1P21399 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACO1P21399 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACO1P21399 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACO1P21399 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACO1P21399 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACO1P21399 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACO1P21399 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACO1P21399 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACO1P21399 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACO1P21399 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACO1P21399 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACO1P21399 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACO1P21399 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACO1P21399 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACO1P21399 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACO1P21399 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACO1P21399 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACO1P21399 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACO1P21399 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACO1P21399 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACO1P21399 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACO1P21399 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACO1P21399 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACO1P21399 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACO1P21399 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACO1P21399 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACO1P21399 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACO1P21399 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACO1P21399 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACO1P21399 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACO1P21399 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACO1P21399 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACO1P21399 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ACO1P21399 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACO1P21399 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACO1P21399 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ACO1P21399 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ACO1P21399 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ACO1P21399 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACO1P21399 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACO1P21399 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACO1P21399 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACO1P21399 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ACO1P21399 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACO1P21399 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACO1P21399 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACO1P21399 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACO1P21399 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACO1P21399 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACO1P21399 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACO1P21399 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACO1P21399 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACO1P21399 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACO1P21399 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACO1P21399 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACO1P21399 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACO1P21399 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACO1P21399 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACO1P21399 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACO1P21399 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ACO1P21399 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ACO1P21399 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACO1P21399 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms