Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMNB1P20700 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMNB1P20700 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms