Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB5AP20339 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms