Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms