Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERCC3P19447 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERCC3P19447 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERCC3P19447 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERCC3P19447 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERCC3P19447 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms