Protein–RNA interactions for Protein: P19388

POLR2E, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2EP19388 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2EP19388 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2EP19388 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2EP19388 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms