Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF1P18846 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATF1P18846 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATF1P18846 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATF1P18846 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATF1P18846 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATF1P18846 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATF1P18846 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATF1P18846 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATF1P18846 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATF1P18846 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATF1P18846 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATF1P18846 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATF1P18846 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATF1P18846 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATF1P18846 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATF1P18846 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATF1P18846 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATF1P18846 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATF1P18846 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATF1P18846 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATF1P18846 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATF1P18846 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATF1P18846 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATF1P18846 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATF1P18846 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATF1P18846 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATF1P18846 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATF1P18846 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATF1P18846 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATF1P18846 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATF1P18846 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATF1P18846 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATF1P18846 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATF1P18846 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATF1P18846 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATF1P18846 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATF1P18846 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATF1P18846 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATF1P18846 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATF1P18846 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATF1P18846 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATF1P18846 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATF1P18846 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATF1P18846 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATF1P18846 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATF1P18846 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATF1P18846 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATF1P18846 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATF1P18846 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATF1P18846 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATF1P18846 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATF1P18846 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATF1P18846 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATF1P18846 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATF1P18846 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATF1P18846 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATF1P18846 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATF1P18846 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATF1P18846 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATF1P18846 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATF1P18846 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATF1P18846 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATF1P18846 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATF1P18846 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATF1P18846 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATF1P18846 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATF1P18846 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATF1P18846 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATF1P18846 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATF1P18846 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATF1P18846 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATF1P18846 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATF1P18846 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATF1P18846 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATF1P18846 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATF1P18846 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATF1P18846 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF1P18846 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF1P18846 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF1P18846 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF1P18846 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF1P18846 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF1P18846 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF1P18846 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF1P18846 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF1P18846 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF1P18846 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF1P18846 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF1P18846 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF1P18846 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF1P18846 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF1P18846 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF1P18846 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF1P18846 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF1P18846 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF1P18846 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF1P18846 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF1P18846 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF1P18846 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms