Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHCEP18577 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHCEP18577 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHCEP18577 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RHCEP18577 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHCEP18577 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHCEP18577 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHCEP18577 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RHCEP18577 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHCEP18577 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHCEP18577 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHCEP18577 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHCEP18577 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHCEP18577 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHCEP18577 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHCEP18577 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHCEP18577 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHCEP18577 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHCEP18577 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHCEP18577 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHCEP18577 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHCEP18577 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHCEP18577 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHCEP18577 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHCEP18577 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHCEP18577 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHCEP18577 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHCEP18577 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHCEP18577 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RHCEP18577 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RHCEP18577 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RHCEP18577 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RHCEP18577 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RHCEP18577 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHCEP18577 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHCEP18577 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHCEP18577 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHCEP18577 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHCEP18577 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHCEP18577 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHCEP18577 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHCEP18577 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHCEP18577 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHCEP18577 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RHCEP18577 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHCEP18577 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHCEP18577 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHCEP18577 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHCEP18577 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHCEP18577 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RHCEP18577 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHCEP18577 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHCEP18577 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHCEP18577 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHCEP18577 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHCEP18577 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHCEP18577 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHCEP18577 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHCEP18577 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RHCEP18577 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHCEP18577 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHCEP18577 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RHCEP18577 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHCEP18577 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHCEP18577 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHCEP18577 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RHCEP18577 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHCEP18577 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHCEP18577 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHCEP18577 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHCEP18577 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHCEP18577 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHCEP18577 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHCEP18577 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHCEP18577 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHCEP18577 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHCEP18577 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHCEP18577 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHCEP18577 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHCEP18577 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHCEP18577 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHCEP18577 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHCEP18577 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHCEP18577 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHCEP18577 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHCEP18577 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHCEP18577 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHCEP18577 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHCEP18577 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RHCEP18577 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHCEP18577 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHCEP18577 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHCEP18577 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHCEP18577 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHCEP18577 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHCEP18577 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHCEP18577 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHCEP18577 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHCEP18577 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHCEP18577 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms