Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCLP18206 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCLP18206 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCLP18206 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VCLP18206 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VCLP18206 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCLP18206 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCLP18206 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCLP18206 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VCLP18206 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCLP18206 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCLP18206 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCLP18206 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCLP18206 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VCLP18206 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCLP18206 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCLP18206 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCLP18206 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCLP18206 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCLP18206 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCLP18206 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCLP18206 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCLP18206 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCLP18206 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCLP18206 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCLP18206 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCLP18206 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCLP18206 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCLP18206 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCLP18206 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCLP18206 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCLP18206 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCLP18206 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCLP18206 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCLP18206 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCLP18206 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCLP18206 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCLP18206 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCLP18206 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCLP18206 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VCLP18206 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCLP18206 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCLP18206 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCLP18206 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCLP18206 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCLP18206 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCLP18206 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCLP18206 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCLP18206 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCLP18206 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCLP18206 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCLP18206 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCLP18206 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCLP18206 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCLP18206 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCLP18206 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCLP18206 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VCLP18206 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VCLP18206 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCLP18206 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCLP18206 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCLP18206 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCLP18206 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCLP18206 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCLP18206 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VCLP18206 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VCLP18206 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCLP18206 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCLP18206 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCLP18206 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCLP18206 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCLP18206 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCLP18206 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCLP18206 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCLP18206 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCLP18206 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCLP18206 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCLP18206 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCLP18206 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCLP18206 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCLP18206 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCLP18206 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCLP18206 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCLP18206 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCLP18206 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCLP18206 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCLP18206 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCLP18206 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VCLP18206 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VCLP18206 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCLP18206 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCLP18206 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCLP18206 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCLP18206 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCLP18206 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCLP18206 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCLP18206 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCLP18206 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCLP18206 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCLP18206 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms