Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EPCAMP16422 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPCAMP16422 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms