Protein–RNA interactions for Protein: P16389

KCNA2, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA2P16389 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
KCNA2P16389 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KCNA2P16389 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms