Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPA1P15085 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPA1P15085 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPA1P15085 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPA1P15085 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPA1P15085 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPA1P15085 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPA1P15085 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPA1P15085 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPA1P15085 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPA1P15085 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPA1P15085 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPA1P15085 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPA1P15085 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPA1P15085 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPA1P15085 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPA1P15085 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPA1P15085 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPA1P15085 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPA1P15085 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPA1P15085 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CPA1P15085 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPA1P15085 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPA1P15085 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPA1P15085 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPA1P15085 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPA1P15085 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CPA1P15085 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPA1P15085 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPA1P15085 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPA1P15085 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPA1P15085 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPA1P15085 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPA1P15085 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPA1P15085 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPA1P15085 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPA1P15085 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPA1P15085 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPA1P15085 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPA1P15085 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPA1P15085 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPA1P15085 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPA1P15085 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPA1P15085 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPA1P15085 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPA1P15085 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CPA1P15085 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CPA1P15085 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPA1P15085 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPA1P15085 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPA1P15085 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPA1P15085 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CPA1P15085 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CPA1P15085 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPA1P15085 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPA1P15085 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPA1P15085 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPA1P15085 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPA1P15085 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPA1P15085 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPA1P15085 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPA1P15085 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPA1P15085 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPA1P15085 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPA1P15085 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPA1P15085 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPA1P15085 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPA1P15085 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPA1P15085 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPA1P15085 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPA1P15085 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPA1P15085 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPA1P15085 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPA1P15085 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPA1P15085 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPA1P15085 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPA1P15085 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPA1P15085 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPA1P15085 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPA1P15085 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPA1P15085 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPA1P15085 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPA1P15085 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPA1P15085 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPA1P15085 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPA1P15085 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPA1P15085 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPA1P15085 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPA1P15085 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPA1P15085 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPA1P15085 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPA1P15085 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPA1P15085 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPA1P15085 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPA1P15085 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPA1P15085 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPA1P15085 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPA1P15085 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPA1P15085 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPA1P15085 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms