Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB3P14651 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms