Protein–RNA interactions for Protein: P14543

NID1, Nidogen-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID1P14543 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NID1P14543 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NID1P14543 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NID1P14543 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NID1P14543 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NID1P14543 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NID1P14543 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NID1P14543 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NID1P14543 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NID1P14543 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NID1P14543 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NID1P14543 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NID1P14543 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NID1P14543 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NID1P14543 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NID1P14543 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NID1P14543 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NID1P14543 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NID1P14543 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NID1P14543 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NID1P14543 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NID1P14543 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NID1P14543 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NID1P14543 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NID1P14543 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NID1P14543 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NID1P14543 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NID1P14543 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NID1P14543 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NID1P14543 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NID1P14543 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NID1P14543 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NID1P14543 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NID1P14543 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NID1P14543 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NID1P14543 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NID1P14543 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NID1P14543 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NID1P14543 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NID1P14543 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NID1P14543 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NID1P14543 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NID1P14543 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NID1P14543 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NID1P14543 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NID1P14543 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NID1P14543 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NID1P14543 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NID1P14543 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NID1P14543 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NID1P14543 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NID1P14543 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NID1P14543 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NID1P14543 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NID1P14543 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NID1P14543 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NID1P14543 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NID1P14543 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NID1P14543 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NID1P14543 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NID1P14543 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NID1P14543 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NID1P14543 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NID1P14543 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NID1P14543 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NID1P14543 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NID1P14543 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NID1P14543 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NID1P14543 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NID1P14543 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NID1P14543 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NID1P14543 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NID1P14543 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NID1P14543 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NID1P14543 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NID1P14543 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NID1P14543 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NID1P14543 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NID1P14543 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NID1P14543 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NID1P14543 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NID1P14543 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NID1P14543 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NID1P14543 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NID1P14543 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NID1P14543 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NID1P14543 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NID1P14543 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NID1P14543 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NID1P14543 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NID1P14543 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NID1P14543 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NID1P14543 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NID1P14543 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NID1P14543 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NID1P14543 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NID1P14543 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NID1P14543 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NID1P14543 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NID1P14543 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms