Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
HLA-EP13747 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-EP13747 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms