Protein–RNA interactions for Protein: P13647

KRT5, Keratin, type II cytoskeletal 5, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT5P13647 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT5P13647 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT5P13647 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT5P13647 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT5P13647 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT5P13647 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT5P13647 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT5P13647 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT5P13647 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT5P13647 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT5P13647 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT5P13647 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT5P13647 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT5P13647 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT5P13647 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT5P13647 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT5P13647 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT5P13647 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT5P13647 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT5P13647 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT5P13647 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT5P13647 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT5P13647 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT5P13647 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT5P13647 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT5P13647 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT5P13647 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT5P13647 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT5P13647 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT5P13647 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT5P13647 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT5P13647 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT5P13647 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT5P13647 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT5P13647 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT5P13647 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT5P13647 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT5P13647 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT5P13647 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT5P13647 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT5P13647 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT5P13647 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT5P13647 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT5P13647 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT5P13647 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT5P13647 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT5P13647 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT5P13647 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT5P13647 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT5P13647 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT5P13647 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT5P13647 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT5P13647 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT5P13647 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT5P13647 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT5P13647 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT5P13647 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT5P13647 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT5P13647 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT5P13647 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT5P13647 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT5P13647 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT5P13647 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT5P13647 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT5P13647 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT5P13647 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT5P13647 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT5P13647 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT5P13647 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT5P13647 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT5P13647 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT5P13647 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT5P13647 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT5P13647 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT5P13647 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT5P13647 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT5P13647 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT5P13647 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT5P13647 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT5P13647 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT5P13647 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT5P13647 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT5P13647 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT5P13647 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT5P13647 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT5P13647 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT5P13647 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT5P13647 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT5P13647 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT5P13647 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT5P13647 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT5P13647 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT5P13647 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT5P13647 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT5P13647 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT5P13647 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT5P13647 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT5P13647 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT5P13647 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT5P13647 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms